diff --git a/conf/airframes/jsbsim.xml b/conf/airframes/jsbsim.xml
index 02a55f0c4c..b1c8892581 100644
--- a/conf/airframes/jsbsim.xml
+++ b/conf/airframes/jsbsim.xml
@@ -206,9 +206,6 @@ sim.srcs += nav_line.c nav_survey_rectangle.c
 #### Config for SITL simulation with JSBSim
 include $(PAPARAZZI_SRC)/conf/autopilot/sitl_jsbsim.makefile
 
-jsbsim.CFLAGS += -I/home/cocoleon/usr/include/JSBSim
-jsbsim.LDFLAGS += -L/home/cocoleon/usr/lib/
-
 jsbsim.CFLAGS += -DBOARD_CONFIG=\"tiny.h\" -DAGR_CLIMB -DLOITER_TRIM -DALT_KALMAN
 jsbsim.srcs += nav_line.c nav_survey_rectangle.c
 jsbsim.srcs += $(SIMDIR)/sim_ac_fw.c
diff --git a/conf/autopilot/sitl_jsbsim.makefile b/conf/autopilot/sitl_jsbsim.makefile
index 51908c6de5..c441c0d05b 100644
--- a/conf/autopilot/sitl_jsbsim.makefile
+++ b/conf/autopilot/sitl_jsbsim.makefile
@@ -1,8 +1,28 @@
+
+ifndef JSBSIM_INC
+JSBSIM_ROOT = /opt/jsbsim
+JSBSIM_INC = $(JSBSIM_ROOT)/include/JSBSim
+JSBSIM_LIB = $(JSBSIM_ROOT)/lib
+endif
+
 jsbsim.ARCHDIR = $(ARCH)
 
 # external libraries
 jsbsim.CFLAGS = -I$(SIMDIR) -I/usr/include `pkg-config glib-2.0 --cflags`
-jsbsim.LDFLAGS += `pkg-config glib-2.0 --libs` -lm -lpcre -lglibivy -L/usr/lib -lJSBSim
+jsbsim.LDFLAGS += `pkg-config glib-2.0 --libs` -lm -lpcre -lglibivy -L/usr/lib
+
+# use the paparazzi-jsbsim package if it is installed, otherwise look for JSBsim under /opt/jsbsim
+ifndef JSBSIM_PKG
+JSBSIM_PKG = $(shell pkg-config JSBSim --exists && echo 'yes')
+endif
+ifeq ($(JSBSIM_PKG), yes)
+	jsbsim.CFLAGS  += `pkg-config JSBSim --cflags`
+	jsbsim.LDFLAGS += `pkg-config JSBSim --libs`
+else
+	JSBSIM_PKG = no
+	jsbsim.CFLAGS  += -I$(JSBSIM_INC)
+	jsbsim.LDFLAGS += -L$(JSBSIM_LIB) -lJSBSim
+endif
 
 jsbsim.CFLAGS += -DSITL -DAP -DFBW -DRADIO_CONTROL -DINTER_MCU -DDOWNLINK -DDOWNLINK_TRANSPORT=IvyTransport -DINFRARED -DNAV -DLED -DWIND_INFO
 jsbsim.srcs = $(SRC_ARCH)/jsbsim_hw.c $(SRC_ARCH)/jsbsim_gps.c $(SRC_ARCH)/jsbsim_ir.c $(SRC_ARCH)/jsbsim_transport.c $(SRC_ARCH)/ivy_transport.c
diff --git a/conf/autopilot/subsystems/rotorcraft/fdm_nps.makefile b/conf/autopilot/subsystems/rotorcraft/fdm_nps.makefile
index aee53cb2d8..62c9b53261 100644
--- a/conf/autopilot/subsystems/rotorcraft/fdm_nps.makefile
+++ b/conf/autopilot/subsystems/rotorcraft/fdm_nps.makefile
@@ -26,13 +26,15 @@ sim.LDFLAGS += `pkg-config glib-2.0 --libs` -lm -lmeschach -lpcre -lglibivy
 sim.CFLAGS  += -I$(NPSDIR) -I$(SRC_FIRMWARE) -I$(SRC_BOOZ) -I$(SRC_BOOZ_SIM) -I$(SRC_BOARD) -I../simulator -I$(PAPARAZZI_HOME)/conf/simulator/nps
 
 # use the paparazzi-jsbsim package if it is installed, otherwise look for JSBsim under /opt/jsbsim
+ifndef JSBSIM_PKG
 JSBSIM_PKG = $(shell pkg-config JSBSim --exists && echo 'yes')
+endif
 ifeq ($(JSBSIM_PKG), yes)
 	sim.CFLAGS  += `pkg-config JSBSim --cflags`
 	sim.LDFLAGS += `pkg-config JSBSim --libs`
 else
 	JSBSIM_PKG = no
-	sim.CFLAGS  += -I/usr/local/include -I$(JSBSIM_INC)
+	sim.CFLAGS  += -I$(JSBSIM_INC)
 	sim.LDFLAGS += -L$(JSBSIM_LIB) -lJSBSim
 endif