diff --git a/conf/autopilot/logger.makefile b/conf/autopilot/logger.makefile
index f6e87ecea4..053631436b 100644
--- a/conf/autopilot/logger.makefile
+++ b/conf/autopilot/logger.makefile
@@ -40,7 +40,7 @@ LOG_MSG_FMT = LOG_PPRZ
 endif
 
 #set the speed
-ap.CFLAGS += -DUSE_UART0 -DUART0_BAUD=$(UART0_BAUD) -DUSE_UART0_RX_ONLY
+ap.CFLAGS += -DUSE_UART0 -DUART0_BAUD=$(UART0_BAUD) -DUSE_UART0_RX_ONLY -DPERIPHERALS_AUTO_INIT
 ap.CFLAGS += -DUSE_UART1 -DUART1_BAUD=$(UART1_BAUD) -DUSE_UART1_RX_ONLY
 ap.srcs += $(SRC_ARCH)/mcu_periph/uart_arch.c
 ap.srcs += mcu_periph/uart.c